Episome , it ģenētikas jomā, ir DNS molekula, kas spēj replicē autonomi citoplazmā saimniekorganisma šūnas, un kas fiziski integrēta uz ka saimniekorganisma šūna ir hromosomas, arī atkārtojumu kā viena molekula (pie kuru mēs saucam par integrētu).
Tāpēc epizomu var interpretēt kā līdzāspastāvēšanas veidu, nevis kā replikona veidu. Faktiski dažiem autoriem transposonus un iespraušanas sekvences var uzskatīt par epizomām, jo tās faktiski tiek pārnestas uz saimnieka šūnas hromosomu, kaut arī citoplazmā tām nekad nav neatkarīgas un autonomas eksistences.
Turpretī eikariotu šūnās epizoma vairāk attiecas uz vīrusu replikoniem, kas inficētajās šūnās vienlaikus pastāv kā plazmīdi, nevis uz vīrusiem, kas var integrēties saimnieka šūnas genomā.
Tas nav vienīgais gadījums, kad viens un tas pats vārds nozīmē dažādas lietas eikariotos un prokariotos (piemēram, termins transformācija). Epizomām ir bagāta vēsture mūsdienu ģenētikas attīstībā, jo tās palīdzēja atšķetināt interesantas parādības, kas saistītas ar iedzimtību.
Epizomas, kas ir bakteriofāgi
Vēl viens no pazīstamākajiem epizomu piemēriem ir auglības faktors vai plazmīda F. Dažreiz atkarībā no saimnieka baktērijas (piemēram, E. coli) nukleotīdu struktūras apļveida plazmīds rekombinējas ar homologām vietām, kas atrodas hromosomā. baktērijas, kas rada kointegrāciju.
Tas ir, plazmidija var replicēties mazā eksemplāru skaitā baktērijas citoplazmā vai, ja tā ir integrēta, replicēt kopumā veselā eksemplāra skaitā, kas atbilst baktērijas bez F (parasti viena).
Savā epizoma stāvoklī F dod baktērijām iespēju saražot lielu daudzumu rekombinantu pēc konjugācijas procesa.
F + baktērija (tas ir, kurai ir autonoma F plazmīda), kurai tiek veikta šī elementa ievietošana, tiek uzskatīta par Hfr (ar augstu rekombinācijas frekvenci, tā akronīmam angļu valodā), jo konjugācijas gadījumā tas teorētiski ir spēj "ievilkt" visu baktēriju hromosomu F-baktērijā (tas ir, bez auglības koeficienta vai F plazmidē).
Parasti sekvences, kas nodrošina homoloģiju (un līdz ar to līdzību un komplementaritāti) starp F plazmīdu un baktēriju hromosomu tā, lai tiktu pārbaudīts vietnei specifiskais rekombinācijas process, kas rada kointegratu, ir iespraušanas sekvences.
Epizomas eikariotu šūnās
Vēsturisku iemeslu dēļ termins epizoma (virs + ķermeņa) vienmēr tika saistīts ar plazmīdu, kas sākotnēji radies no ekstrahromosomu elementu pasaules prokariotos.
Atrodot līdzīgus elementus eikariotos, tika pieņemts izmantot tos, lai apzīmētu vīrusa genomu molekulas, kas spēj patstāvīgi replicēties šāda veida inficētajās šūnās ar īpašībām, kas ir līdzīgas prokariotu plazmīdu īpašībām.
Tas ir, eikariotu šūnās, kas inficētas ar vīrusiem, dažos gadījumos mēs varam atrast, ka vīruss tā replikācijas cikla ietvaros šūnā pastāv līdzās kā apļveida DNS molekula, kas ir līdzīga šiem citiem replikoniem, kas aprakstīti, piemēram, baktērijās.
Visizplatītākie vīrusi, kas vienlaikus var pastāvēt kā autonomi replicējošas apļveida DNS molekulas (no saimnieka hromosomas), pieder Herpesviridae, Adenoviridae un Polyomaviridae ģimenēm.
Tomēr neviens no tiem nav integrēts saimnieka genomā, tāpēc var uzskatīt, ka tie replicējas kā plazmīdas un ka tie neatbilst raksturīgajai kvalitātei, kas raksturo epizomu: integrēties saimnieka genomā.
Lai gan ir ierosināts atcelt terminu, iespējams, tas tikai radīs neskaidrības tēmai, kas pati par sevi jau ir diezgan sarežģīta.
Secinājumi
Kopsavilkumā mēs varam teikt, ka epizoma, etimoloģiski runājot, ir autonomas replikācijas ģenētiskais elements, kas šūnā var pastāvēt līdzās kā brīva DNS molekula vai fiziski integrēts saimnieka ķermenī.
Tomēr no ģenētikas viedokļa epizoma ir plazmidija vai vīruss, kas var integrēties prokariotu genomā, vai arī ir viens no plazmīdu veidiem, ko var saturēt eikariotu šūna.
Interesanti, ka vīrusi, kas var ievietoties eikariotu saimnieka (retrovīrusa) genomā, netiek uzskatīti par epizomām.
Atsauces
- Brock, TD 1990. Baktēriju ģenētikas rašanās. Aukstā pavasara ostas laboratorijas prese. Cold Spring Harbor, MA, Amerikas Savienotās Valstis.
- Griffiths, AJF, Wessler, SR, Carroll, SB & Doebley, J. Ievads ģenētiskajā analīzē. WH Freeman & Co, McMillan Publishers. Londona, Apvienotā Karaliste.
- Hayes, W. 1971. Baktēriju un to vīrusu ģenētika, otrais izdevums. Blekvelas zinātniskās publikācijas.
- Jēkabs, F. un Volmans, EL 1958. Les episomes, elements génétiques ajoutés. Comptes Rendus de l'Académie des Sciences de Paris, 247 (1): 154–156.
- Levy, JA, Fraenkel-Conrat, H. & Owens, OS 1994. Viroloģija, 3. izdevums. Prentice zāle. Englerwood Cliffs, NJ, Amerikas Savienotās Valstis.